Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc10Q3TLI0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms