Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam178bQ24JP3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms