Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd300lgQ1ERP8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms