Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpusd2Q149F1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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