Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf3ip1Q149C2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Traf3ip1Q149C2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms