Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Spatc1Q148B6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms