Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cntnap5cQ0V8T7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cntnap5cQ0V8T7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms