Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pate4Q09098 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms