Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
MestQ07646 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
MestQ07646 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MestQ07646 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms