Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apoc2Q05020 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoc2Q05020 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms