Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx2Q04744 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms