Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Msx2Q03358 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Msx2Q03358 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms