Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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NfiaQ02780 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NfiaQ02780 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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