Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb4Q02738 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms