Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd1Q01822 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms