Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cacna1cQ01815 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms