Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2aQ01320 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Top2aQ01320 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms