Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col1a2Q01149 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms