Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin2bQ01097 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grin2bQ01097 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms