Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb2Q00977 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms