Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GabpaQ00422 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms