Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabpb1Q00420 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabpb1Q00420 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms