Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmsP97355 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmsP97355 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SmsP97355 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SmsP97355 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SmsP97355 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SmsP97355 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SmsP97355 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmsP97355 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmsP97355 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmsP97355 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmsP97355 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SmsP97355 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms