Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Nucb2P81117 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nucb2P81117 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms