Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ldb1P70662 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ldb1P70662 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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