Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3P62908 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps3P62908 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps3P62908 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms