Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pcbp1P60335 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pcbp1P60335 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms