Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csrnp3P59055 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csrnp3P59055 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms