Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ctdsp1P58466 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ctdsp1P58466 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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