Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samsn1P57725 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Samsn1P57725 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms