Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Exosc10P56960 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms