Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CartptP56388 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CartptP56388 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CartptP56388 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms