Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lbx1P52955 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lbx1P52955 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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