Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CcnfP51944 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcnfP51944 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms