Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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PtpreP49446 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtpreP49446 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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