Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Epb42P49222 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Epb42P49222 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms