Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VdrP48281 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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VdrP48281 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VdrP48281 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
VdrP48281 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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