Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syt1P46096 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syt1P46096 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms