Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Mmp9P41245 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mmp9P41245 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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