Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VhlP40338 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VhlP40338 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VhlP40338 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms