Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnar1P33896 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms