Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SsbP32067 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SsbP32067 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SsbP32067 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SsbP32067 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms