Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms