Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcdP28867 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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