Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RxraP28700 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms