Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Lef1P27782 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Lef1P27782 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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