Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PdgfraP26618 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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