Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NdnP25233 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms