Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fcer1aP20489 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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