Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TP20293 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TP20293 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TP20293 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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